[Genepop format: Batracho MLST data 45 individuals, diploid genotypes] 6873X2 8392X2 8009X2 6677X2 b7-10c BDC5 8329X2 BdSC1.2 BdSC1.2.4 BDC24 9893X2 BdSC2.02 BdSC3.1 BdSC3.9 BdSC4.3 BdSC4.16 BdSC5.1 BdSC5.6.1 BdSC5.6.2 BdSC6.2 BdSC6.6.1 BdSC6.6.2 BdSC6.15 BdSC7.6 BdSC8.10 BdSC9.7 BdSC12.4 APRT13 R6046 8702X2 6164Y2 mb-b13 BDC18.1 BDC18.2 CTSYN1 HMG17 POP JEL253, 0101 0101 0101 0101 0101 0101 0101 0101 0101 0101 0101 0101 0101 0202 0101 0102 0101 0102 0102 0101 0102 0102 0101 0102 0101 0102 0102 0102 0101 0102 0102 0102 0102 0102 0101 0102 CW34, 0101 0101 0101 0101 0101 0102 0102 0102 0101 0101 0101 0102 0102 0102 0101 0102 0101 0102 0102 0101 0102 0102 0101 0102 0101 0102 0102 0102 0101 0202 0102 0102 0102 0102 0202 0102 CW36, 0101 0101 0102 0102 0102 0102 0102 0102 0101 0101 0101 0102 0101 0202 0101 0202 0101 0102 0102 0101 0102 0102 0101 0102 0101 0102 0102 0202 0101 0102 0102 0102 0102 0102 0102 0102 JEL225, 0102 0102 0102 0102 0102 0102 0101 0102 0101 0101 0101 0101 0102 0102 0101 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CTGATGCGTGGAGGGTATTACCACGAAGTTCGGCTTCACGGATAGTACGAGCCAAATTGTCACCTGGAAGAGCCTAGTAGAGATCATTGATTACAACATTCAACAATGAAGGGTTAGTATGCGCGATTTACTACGACTGAGCTGATGCATCATGTAATAGGATCAGCAAAAGTATCTGCAGATGCAATAAACCCATTAACAATGCTTAAAGATCATTAAGCAGTGATATCCGTTATATTTCAACAACTGCTGATCAGTCATACAAGTCAATGCAATCAACGAATG(A)CAGCATCAGTTGT(ACTA)ACAACTGATGCTGAATTGATCAAGAGTAAAGACTACCGCAAAGCATTGTTTTAAACAAGACATGCTCTCCACTATCCTCATGATAATCAAGCCGTCAAAGACACCAATAGCAATGAGTCTGTGCGCAGGATAAAAAACCCTTCACCCACTGTGTATCAATGCATTCTTACTCTAAGAAGACAAGCCTTGAGCATATGAGCAGTTCCAGGAGCATCAGCAGTGTCGAAGCGAGAGCCAGCATTGACCACAATTGCCAGAGTCGAAGCAGGCCCAAAGTGGTCGTACGTGGCCACATTGACA >allele_02_JEL197 CTGATGCGTGGAGGGTATTACCACGAAGTTCGGCTTCACGGATAGTACGAGCCAAATTGTCACCTGGAAGAGCCTAGTAGAGATCATTGATTACAACATTCAACAATGAAGGGTTAGTATGCGCGATTTACTACGACTGAGCTGATGCATCATGTAATAGGATCAGCAAAAGTATCTGCAGATGCAATAAACCCATTAACAATGCTTAAAGATCATTAAGCAGTGATATCCGTTATATTTCAACAACTGCTGATCAGTCATACAAGTCAATGCAATCAACGAATG(A)CAGCATCAGTTGT(TAGT)ACAACTGATGCTGAATTGATCAAGAGTAAAGACTACCGCAAAGCATTGTTTTAAACAAGACATGCTCTCCACTATCCTCATGATAATCAAGCCGTCAAAGACACCAATAGCAATGAGTCTGTGCGCAGGATAAAAAACCCTTCACCCACTGTGTATCAATGCATTCTTACTCTAAGAAGACAAGCCTTGAGCATATGAGCAGTTCCAGGAGCATCAGCAGTGTCGAAGCGAGAGCCAGCATTGACCACAATTGCCAGAGTCGAAGCAGGCCCAAAGTGGTCGTACGTGGCCACATTGACA >allele_03_UM142 CTGATGCGTGGAGGGTATTACCACGAAGTTCGGCTTCACGGATAGTACGAGCCAAATTGTCACCTGGAAGAGCCTAGTAGAGATCATTGATTACAACATTCAACAATGAAGGGTTAGTATGCGCGATTTACTACGACTGAGCTGATGCATCATGTAATAGGATCAGCAAAAGTATCTGCAGATGCAATAAACCCATTAACAATGCTTAAAGATCATTAAGCAGTGATATCCGTTATATTTCAACAACTGCTGATCAGTCATACAAGTCAATGCAATCAACGAATG(G)CAGCATCAGTTGT(ACTA)ACAACTGATGCTGAATTGATCAAGAGTAAAGACTACCGCAAAGCATTGTTTTAAACAAGACATGCTCTCCACTATCCTCATGATAATCAAGCCGTCAAAGACACCAATAGCAATGAGTCTGTGCGCAGGATAAAAAACCCTTCACCCACTGTGTATCAATGCATTCTTACTCTAAGAAGACAAGCCTTGAGCATATGAGCAGTTCCAGGAGCATCAGCAGTGTCGAAGCGAGAGCCAGCATTGACCACAATTGCCAGAGTCGAAGCAGGCCCAAAGTGGTCGTACGTGGCCACATTGACA 9893X2 >allele_01_JEL197 TGTTATCTTAACCCCAATAGTCTCGAGTGTTTTCCTAATACAGCTCGTAGATTATATACATTTTTAAATATATATA(--)CGCTGATTAAAAAGTATATTATTGATTTTT >allele_02_JEL270 TGTTATCTTAACCCCAATAGTCTCGAGTGTTTTCCTAATACAGCTCGTAGATTATATACATTTTTAAATATATATA(TA)CGCTGATTAAAAAGTATATTATTGATTTTT BdSC2.02 >allele_01_JEL197 TTATCTGATCCTTCAGCAATGATTTGTTTTGACGCAGCCTATCAAATTTCTATTATTCTATCACGTTTTACAAAGTATAATCC(G)GGATTTGCATATGTTGGATGGTTGTTTGCACTTGGTTTATTCCGAGCGGGGATTGTATTTATTCTGTCGATCCGAATGGGAATCGTAGATCCATATTCAGGGGATGATCCAGCCGAATTGCTAGATATGCAGATCACATCG(C)TAAAGCAGATTGGTAGGTTTTGGATTTTAGCAAAACA(T)TTGGCCAACAGTCTTGAGATTTGGCGAGACAGTGGACGGGATATTGGGGCAGCACATGTTGCCTCGCTGCGACGGAGTGAATTATAATATAGAGCCGTCAATTACGAGATGATG >allele_02_JEL213 TTATCTGATCCTTCAGCAATGATTTGTTTTGACGCAGCCTATCAAATTTCTATTATTCTATCACGTTTTACAAAGTATAATCC(A)GGATTTGCATATGTTGGATGGTTGTTTGCACTTGGTTTATTCCGAGCGGGGATTGTATTTATTCTGTCGATCCGAATGGGAATCGTAGATCCATATTCAGGGGATGATCCAGCCGAATTGCTAGATATGCAGATCACATCG(C)TAAAGCAGATTGGTAGGTTTTGGATTTTAGCAAAACA(T)TTGGCCAACAGTCTTGAGATTTGGCGAGACAGTGGACGGGATATTGGGGCAGCACATGTTGCCTCGCTGCGACGGAGTGAATTATAATATAGAGCCGTCAATTACGAGATGATG >allele_03_UM142 TTATCTGATCCTTCAGCAATGATTTGTTTTGACGCAGCCTATCAAATTTCTATTATTCTATCACGTTTTACAAAGTATAATCC(A)GGATTTGCATATGTTGGATGGTTGTTTGCACTTGGTTTATTCCGAGCGGGGATTGTATTTATTCTGTCGATCCGAATGGGAATCGTAGATCCATATTCAGGGGATGATCCAGCCGAATTGCTAGATATGCAGATCACATCG(C)TAAAGCAGATTGGTAGGTTTTGGATTTTAGCAAAACA(C)TTGGCCAACAGTCTTGAGATTTGGCGAGACAGTGGACGGGATATTGGGGCAGCACATGTTGCCTCGCTGCGACGGAGTGAATTATAATATAGAGCCGTCAATTACGAGATGATG >allele_04_JEL648 TTATCTGATCCTTCAGCAATGATTTGTTTTGACGCAGCCTATCAAATTTCTATTATTCTATCACGTTTTACAAAGTATAATCC(A)GGATTTGCATATGTTGGATGGTTGTTTGCACTTGGTTTATTCCGAGCGGGGATTGTATTTATTCTGTCGATCCGAATGGGAATCGTAGATCCATATTCAGGGGATGATCCAGCCGAATTGCTAGATATGCAGATCACATCG(T)TAAAGCAGATTGGTAGGTTTTGGATTTTAGCAAAACA(C)TTGGCCAACAGTCTTGAGATTTGGCGAGACAGTGGACGGGATATTGGGGCAGCACATGTTGCCTCGCTGCGACGGAGTGAATTATAATATAGAGCCGTCAATTACGAGATGATG BdSC3.1 >allele_01_JEL197 TGTGGGTAGAGAGAGCTCAATATGTGCTCCAGCATCCCGCAAGTCATTAATGAGATGAACGAGTTTACATGAACGACGACTATATACAGTTTTTTCCAAAGCACTCGCATCTGTAACCCATGACATTTTATTATTATTGATAGTATCAGTAGAAGGAATGGATGGCAAGTTGCCAAGTGTATGTTTGAGTGGCTGTAGATGGACTGCAGTTGAATGAAAAGGTGTGATGGA(A)TGAGGCGGAAAAAGACTAGTTTTAAAAGACTTGTCCGCAGTGTTGATGGACG(T)TTGAGAAGAATGCCCGTTTGTAACTATGCTAGGCTTGATGAATGCTGTCTTTGTATCTATCTGTTGATGTTGGTTTATCTTCGCGA >allele_02_JEL231 TGTGGGTAGAGAGAGCTCAATATGTGCTCCAGCATCCCGCAAGTCATTAATGAGATGAACGAGTTTACATGAACGACGACTATATACAGTTTTTTCCAAAGCACTCGCATCTGTAACCCATGACATTTTATTATTATTGATAGTATCAGTAGAAGGAATGGATGGCAAGTTGCCAAGTGTATGTTTGAGTGGCTGTAGATGGACTGCAGTTGAATGAAAAGGTGTGATGGA(G)TGAGGCGGAAAAAGACTAGTTTTAAAAGACTTGTCCGCAGTGTTGATGGACG(T)TTGAGAAGAATGCCCGTTTGTAACTATGCTAGGCTTGATGAATGCTGTCTTTGTATCTATCTGTTGATGTTGGTTTATCTTCGCGA >allele_03_UM142 TGTGGGTAGAGAGAGCTCAATATGTGCTCCAGCATCCCGCAAGTCATTAATGAGATGAACGAGTTTACATGAACGACGACTATATACAGTTTTTTCCAAAGCACTCGCATCTGTAACCCATGACATTTTATTATTATTGATAGTATCAGTAGAAGGAATGGATGGCAAGTTGCCAAGTGTATGTTTGAGTGGCTGTAGATGGACTGCAGTTGAATGAAAAGGTGTGATGGA(G)TGAGGCGGAAAAAGACTAGTTTTAAAAGACTTGTCCGCAGTGTTGATGGACG(C)TTGAGAAGAATGCCCGTTTGTAACTATGCTAGGCTTGATGAATGCTGTCTTTGTATCTATCTGTTGATGTTGGTTTATCTTCGCGA BdSC3.9 >allele_01_LMS929 GTCAATTATTTCTAATAGTTGAGATGACATACATATCAAGACTTACTTCAATGTATTCTTTCATGATTCCGTTGTAAAGTCGATCGTCTCCCCACTGGCGACGAATAAAAAAAGCTCCATTGTGACGAAGTAGCCATCCCACAAACGGCATATTGAGATTATCTCCTGCAGCAATATGCGGCAACGCAAACCCAAGACGGTACAGAATATAGCTATGTATTTCCATTAAGCCATATTAGATTTTATTTGAC(A)GATCCAAGATTGAGTGGTTTCGATGGACAACAGCATGAATAAAACCTCACCTGACAACTAAATAATCAATGTGACTTTTGTGGCATGGAAGAAATACTAACGATAGTCCTCT >allele_02_CW36 GTCAATTATTTCTAATAGTTGAGATGACATACATATCAAGACTTACTTCAATGTATTCTTTCATGATTCCGTTGTAAAGTCGATCGTCTCCCCACTGGCGACGAATAAAAAAAGCTCCATTGTGACGAAGTAGCCATCCCACAAACGGCATATTGAGATTATCTCCTGCAGCAATATGCGGCAACGCAAACCCAAGACGGTACAGAATATAGCTATGTATTTCCATTAAGCCATATTAGATTTTATTTGAC(G)GATCCAAGATTGAGTGGTTTCGATGGACAACAGCATGAATAAAACCTCACCTGACAACTAAATAATCAATGTGACTTTTGTGGCATGGAAGAAATACTAACGATAGTCCTCT BdSC4.3 >allele_01_JEL197 CGCAGTACAATGT(A)AATACCAACAAATAAGGTCA(G)TTCATAATCATTTTTAATCATCAAAAGCAACTCAAATTTTAAAACCTAATACACACCTCTATTTCCAACGGCTTTTTATCCGT(A)GCCTGTTTTCTAATCTGTTCAAGAACAGTAGGACTTAGATATACAATCGACGATTGTCCCCAAAACACGCGTTTTGTTTCTTTGATTTCTACTGGATCACTGTCAGCCTCTTCAAGCGGCTGGGAAGAAGAAACCCCTGCTGCAGACGCCAATGTAGCTTGGGCTGTATGTTCTTTTCGAATGTCTGCCAGCGTGACAGTTCGCGGAACATTTGCAATTGGATCTACAAAAAATGAAATATTAAATTCTGG(G)ATCAA(A)TA(C)TCTACTGTAATTTGATTT(GT)ATCT(A)AATATC(A)CATCATTCAATACCAGAAACTA >allele_02_JEL231 CGCAGTACAATGT(G)AATACCAACAAATAAGGTCA(G)TTCATAATCATTTTTAATCATCAAAAGCAACTCAAATTTTAAAACCTAATACACACCTCTATTTCCAACGGCTTTTTATCCGT(A)GCCTGTTTTCTAATCTGTTCAAGAACAGTAGGACTTAGATATACAATCGACGATTGTCCCCAAAACACGCGTTTTGTTTCTTTGATTTCTACTGGATCACTGTCAGCCTCTTCAAGCGGCTGGGAAGAAGAAACCCCTGCTGCAGACGCCAATGTAGCTTGGGCTGTATGTTCTTTTCGAATGTCTGCCAGCGTGACAGTTCGCGGAACATTTGCAATTGGATCTACAAAAAATGAAATATTAAATTCTGG(A)ATCAA(C)TA(T)TCTACTGTAATTTGATTT(GT)ATCT(G)AATATC(A)CATCATTCAATACCAGAAACTA >allele_03_UM142 CGCAGTACAATGT(A)AATACCAACAAATAAGGTCA(T)TTCATAATCATTTTTAATCATCAAAAGCAACTCAAATTTTAAAACCTAATACACACCTCTATTTCCAACGGCTTTTTATCCGT(G)GCCTGTTTTCTAATCTGTTCAAGAACAGTAGGACTTAGATATACAATCGACGATTGTCCCCAAAACACGCGTTTTGTTTCTTTGATTTCTACTGGATCACTGTCAGCCTCTTCAAGCGGCTGGGAAGAAGAAACCCCTGCTGCAGACGCCAATGTAGCTTGGGCTGTATGTTCTTTTCGAATGTCTGCCAGCGTGACAGTTCGCGGAACATTTGCAATTGGATCTACAAAAAATGAAATATTAAATTCTGG(G)ATCAA(C)TA(T)TCTACTGTAATTTGATTT(TC)ATCT(G)AATATC(T)CATCATTCAATACCAGAAACTA BdSC4.16 >allele_01_JEL197 TGATGGTTCGTTTCCATGGAT(C)ATCAGTATGT(A)TATCTGCTGGATTGGACTGTATCGG(A)GAATGTATGGTTCTATGTG(C)ATTAGACATTGGAGAAACTGGAGTTGACGATCGTTGTGACGGAGTTGAAGGTTTTTTACGAGATGCATTCGTAGTCTGTAAGCATCGAGCAACCCAAGGCATAGTAGAATCAATCTGTATTTCAGCAGTCCATCCACCCATTGATCGATCTGTCTTCCATTGCAAAGACGGTTTACCAAAATGTGATAGCAGCTGATCCAAGAGAATCATTCCTACAGAGTGTCGGGTTGTTGGATAGGTAAAGTTTCCCAATCCAACCACCTGTCATTGCAGCGATTGAATCAATAGTTAGCTGGATGGTTCACACTGATGACTTGAATATCAACTATTCTGACTTGCCAATACAGGAGATAGTTGTTTATACTGCAACTCGGTAGTTACAGATGGAATAGTAGAATAACTAGCAGTGGAGAATGGCTGGC >allele_02_JEL275 TGATGGTTCGTTTCCATGGAT(C)ATCAGTATGT(G)TATCTGCTGGATTGGACTGTATCGG(G)GAATGTATGGTTCTATGTG(T)ATTAGACATTGGAGAAACTGGAGTTGACGATCGTTGTGACGGAGTTGAAGGTTTTTTACGAGATGCATTCGTAGTCTGTAAGCATCGAGCAACCCAAGGCATAGTAGAATCAATCTGTATTTCAGCAGTCCATCCACCCATTGATCGATCTGTCTTCCATTGCAAAGACGGTTTACCAAAATGTGATAGCAGCTGATCCAAGAGAATCATTCCTACAGAGTGTCGGGTTGTTGGATAGGTAAAGTTTCCCAATCCAACCACCTGTCATTGCAGCGATTGAATCAATAGTTAGCTGGATGGTTCACACTGATGACTTGAATATCAACTATTCTGACTTGCCAATACAGGAGATAGTTGTTTATACTGCAACTCGGTAGTTACAGATGGAATAGTAGAATAACTAGCAGTGGAGAATGGCTGGC >allele_03_UM142 TGATGGTTCGTTTCCATGGAT(T)ATCAGTATGT(A)TATCTGCTGGATTGGACTGTATCGG(G)GAATGTATGGTTCTATGTG(T)ATTAGACATTGGAGAAACTGGAGTTGACGATCGTTGTGACGGAGTTGAAGGTTTTTTACGAGATGCATTCGTAGTCTGTAAGCATCGAGCAACCCAAGGCATAGTAGAATCAATCTGTATTTCAGCAGTCCATCCACCCATTGATCGATCTGTCTTCCATTGCAAAGACGGTTTACCAAAATGTGATAGCAGCTGATCCAAGAGAATCATTCCTACAGAGTGTCGGGTTGTTGGATAGGTAAAGTTTCCCAATCCAACCACCTGTCATTGCAGCGATTGAATCAATAGTTAGCTGGATGGTTCACACTGATGACTTGAATATCAACTATTCTGACTTGCCAATACAGGAGATAGTTGTTTATACTGCAACTCGGTAGTTACAGATGGAATAGTAGAATAACTAGCAGTGGAGAATGGCTGGC BdSC5.1 >allele_01_CW34 AGAGCCAGTGACTCATCATAATATTAAAGAAATGCGAAG(A)TGTGTTGTTAACGGACCATTAAAATGGCCTGGCGCTACCCACGT(C)GAGAACGAAGATGGAACGCTTATATCTTTGAGTTCTTTTGATGATGCTGGTCGAACAGCCATTGCCAATCAGCTTCTTACCCCAAGTATGCATCATGGTGAAACCAACCACTCGTATAACTTTGATCACGTCAACAAGAAAGTATATCGTCATATTCGCAATGGCGATTTTCTGCTTTTGAATCGTCAACCCACTCTACATAAGCCATCTATTATGGCCCATACTGC(C)CGTGTGTTGCCTGGGGAAAAAACTATTCGTATGCACTATGCCAACTGTAATACCTACAATGCTGATTTTGATGGTGATGAAATGAATATACATTTCCCCCAAAATGAGATTGCTCGTGCCGAAGCCATGTTGATTGCACGTAACGATCAGCAATATTTGGTTCCAACTGATGGCGGTGTA >allele_02_JEL197 AGAGCCAGTGACTCATCATAATATTAAAGAAATGCGAAG(A)TGTGTTGTTAACGGACCATTAAAATGGCCTGGCGCTACCCACGT(T)GAGAACGAAGATGGAACGCTTATATCTTTGAGTTCTTTTGATGATGCTGGTCGAACAGCCATTGCCAATCAGCTTCTTACCCCAAGTATGCATCATGGTGAAACCAACCACTCGTATAACTTTGATCACGTCAACAAGAAAGTATATCGTCATATTCGCAATGGCGATTTTCTGCTTTTGAATCGTCAACCCACTCTACATAAGCCATCTATTATGGCCCATACTGC(T)CGTGTGTTGCCTGGGGAAAAAACTATTCGTATGCACTATGCCAACTGTAATACCTACAATGCTGATTTTGATGGTGATGAAATGAATATACATTTCCCCCAAAATGAGATTGCTCGTGCCGAAGCCATGTTGATTGCACGTAACGATCAGCAATATTTGGTTCCAACTGATGGCGGTGTA >allele_03_UM142 AGAGCCAGTGACTCATCATAATATTAAAGAAATGCGAAG(G)TGTGTTGTTAACGGACCATTAAAATGGCCTGGCGCTACCCACGT(C)GAGAACGAAGATGGAACGCTTATATCTTTGAGTTCTTTTGATGATGCTGGTCGAACAGCCATTGCCAATCAGCTTCTTACCCCAAGTATGCATCATGGTGAAACCAACCACTCGTATAACTTTGATCACGTCAACAAGAAAGTATATCGTCATATTCGCAATGGCGATTTTCTGCTTTTGAATCGTCAACCCACTCTACATAAGCCATCTATTATGGCCCATACTGC(T)CGTGTGTTGCCTGGGGAAAAAACTATTCGTATGCACTATGCCAACTGTAATACCTACAATGCTGATTTTGATGGTGATGAAATGAATATACATTTCCCCCAAAATGAGATTGCTCGTGCCGAAGCCATGTTGATTGCACGTAACGATCAGCAATATTTGGTTCCAACTGATGGCGGTGTA [Due to incomplete disequilibrium and the inability to infer phase BdSC5.6 is divided into two loci BdSC5.6.1 and BdSC5.6.2] BdSC5.6.1 >allele_01_JEL428 TGTTGCAAACAGTCCGTTCATAAGCGTACTTTTTTCTGATTCCGTCTAATAATCACAAGTCATATACGTACGAGGTAAGAAATTTGGTTTAAATGCAATAGTTTCAATCGGAATAAACATGCACATTTAAAATTTACCTGAGTCAAGTCAAAGTCAGGATTACGCAAAATACCCATTGTGGTTCTCCATAAATGAAACCAAAGTTT(T)CCGACTTTGGCAGCACAACGACGCTCTTCCAATTTTAGCAGTTGGCGCCATGTATTGAGTTCAAGTCGACGCCATTTGACAATAAATAAAACTATATCATCTAAACACATCTTGAGAGACACCTCCTTGCTGGCATACGCTTCCCAGTC(C)TGACTTTTGATCAGCAATAGCTCAATTCCAGTCAGTAGTTTCATGAGTGGGGATGCAACGGGAAAT >allele_02_JEL648 TGTTGCAAACAGTCCGTTCATAAGCGTACTTTTTTCTGATTCCGTCTAATAATCACAAGTCATATACGTACGAGGTAAGAAATTTGGTTTAAATGCAATAGTTTCAATCGGAATAAACATGCACATTTAAAATTTACCTGAGTCAAGTCAAAGTCAGGATTACGCAAAATACCCATTGTGGTTCTCCATAAATGAAACCAAAGTTT(G)CCGACTTTGGCAGCACAACGACGCTCTTCCAATTTTAGCAGTTGGCGCCATGTATTGAGTTCAAGTCGACGCCATTTGACAATAAATAAAACTATATCATCTAAACACATCTTGAGAGACACCTCCTTGCTGGCATACGCTTCCCAGTC(C)TGACTTTTGATCAGCAATAGCTCAATTCCAGTCAGTAGTTTCATGAGTGGGGATGCAACGGGAAAT >allele_03_UM142 TGTTGCAAACAGTCCGTTCATAAGCGTACTTTTTTCTGATTCCGTCTAATAATCACAAGTCATATACGTACGAGGTAAGAAATTTGGTTTAAATGCAATAGTTTCAATCGGAATAAACATGCACATTTAAAATTTACCTGAGTCAAGTCAAAGTCAGGATTACGCAAAATACCCATTGTGGTTCTCCATAAATGAAACCAAAGTTT(G)CCGACTTTGGCAGCACAACGACGCTCTTCCAATTTTAGCAGTTGGCGCCATGTATTGAGTTCAAGTCGACGCCATTTGACAATAAATAAAACTATATCATCTAAACACATCTTGAGAGACACCTCCTTGCTGGCATACGCTTCCCAGTC(T)TGACTTTTGATCAGCAATAGCTCAATTCCAGTCAGTAGTTTCATGAGTGGGGATGCAACGGGAAAT BdSC5.6.2 >allele_01_JEL428 GACGCGATTCGTCGGCAAATAGCACTCAAATGAACCAATACATCATGATCAGGCCATTGTGCAAGAAGATCATTTATACGG(T)TATCAAATTTCACTAAGAGAGATTGAATTTGTTGAGCCTCGTATACATTGGAGTCGTTGTAAAAGTCATACACATCTGAATCAGAAACATTTGTAGTGGAAAA >allele_02_JEL649 GACGCGATTCGTCGGCAAATAGCACTCAAATGAACCAATACATCATGATCAGGCCATTGTGCAAGAAGATCATTTATACGG(C)TATCAAATTTCACTAAGAGAGATTGAATTTGTTGAGCCTCGTATACATTGGAGTCGTTGTAAAAGTCATACACATCTGAATCAGAAACATTTGTAGTGGAAAA BdSC6.2 >allele_01_CW34 TACACTCCTGCTGATCCTGCAGTTGCCACTCGTAAACTTTCTGAAAATGTCCTCAACAAAATTGCTCTCTCTATTCCCGAACTTGTTGGTGGATCAGCTGATTTAACTGGATCCAATCTTACTCGTTGGAAGGGTGCTGTTGACTTTCAGCCAGTACGTGTACTCTATCAATGATATCATTTTCCAGTCTAATGCTTACAATCAACTATTTTTG(G)TTTTTAAAAGGATGTTTCTGGCTTGGGATC(G)TATGCTGGTCGTTACATTCGATTTGGCGTTCGCGAGCACGGCATGGCTGCCATCTGCAACGGCATGAACGCCTATGGTGGCATTATTCCTTTTGGTGCTACATTCTTCAACTTTATCAGGTAAACTTGTGATCTTTCAATGTTGGGTGG(T)TTTATTTGACTTTGACATTGATGTAAAACTGCAG(C)TATGCCCTCGGTGCTGTTCGTTTGTCTGCCCTCTCTAAACATCAGGTCATCTACATTATGACCCACGACTCTATTGGTCTTGGTGAAGATGGTCCCACTCATCAGCCCATCGAGACACTTGCGAGTTTGCGTG >allele_02_JEL197 TACACTCCTGCTGATCCTGCAGTTGCCACTCGTAAACTTTCTGAAAATGTCCTCAACAAAATTGCTCTCTCTATTCCCGAACTTGTTGGTGGATCAGCTGATTTAACTGGATCCAATCTTACTCGTTGGAAGGGTGCTGTTGACTTTCAGCCAGTACGTGTACTCTATCAATGATATCATTTTCCAGTCTAATGCTTACAATCAACTATTTTTG(G)TTTTTAAAAGGATGTTTCTGGCTTGGGATC(G)TATGCTGGTCGTTACATTCGATTTGGCGTTCGCGAGCACGGCATGGCTGCCATCTGCAACGGCATGAACGCCTATGGTGGCATTATTCCTTTTGGTGCTACATTCTTCAACTTTATCAGGTAAACTTGTGATCTTTCAATGTTGGGTGG(T)TTTATTTGACTTTGACATTGATGTAAAACTGCAG(T)TATGCCCTCGGTGCTGTTCGTTTGTCTGCCCTCTCTAAACATCAGGTCATCTACATTATGACCCACGACTCTATTGGTCTTGGTGAAGATGGTCCCACTCATCAGCCCATCGAGACACTTGCGAGTTTGCGTG >allele_03_UM142 TACACTCCTGCTGATCCTGCAGTTGCCACTCGTAAACTTTCTGAAAATGTCCTCAACAAAATTGCTCTCTCTATTCCCGAACTTGTTGGTGGATCAGCTGATTTAACTGGATCCAATCTTACTCGTTGGAAGGGTGCTGTTGACTTTCAGCCAGTACGTGTACTCTATCAATGATATCATTTTCCAGTCTAATGCTTACAATCAACTATTTTTG(A)TTTTTAAAAGGATGTTTCTGGCTTGGGATC(A)TATGCTGGTCGTTACATTCGATTTGGCGTTCGCGAGCACGGCATGGCTGCCATCTGCAACGGCATGAACGCCTATGGTGGCATTATTCCTTTTGGTGCTACATTCTTCAACTTTATCAGGTAAACTTGTGATCTTTCAATGTTGGGTGG(C)TTTATTTGACTTTGACATTGATGTAAAACTGCAG(T)TATGCCCTCGGTGCTGTTCGTTTGTCTGCCCTCTCTAAACATCAGGTCATCTACATTATGACCCACGACTCTATTGGTCTTGGTGAAGATGGTCCCACTCATCAGCCCATCGAGACACTTGCGAGTTTGCGTG [Due to incomplete disequilibrium and the inability to infer phase BdSC6.6 is divided into two loci BdSC6.6.1 and BdSC6.6.2] BdSC6.6.1 >allele_01_UM142 TTTGAAGACAACTGATGGCAATCGGAATGAGTTTTGGATTTTTAGTATCGCACGACATGATGAATGGCTTGACTGTATCATCAGTGTTTGCTAGATCTAGACAGTTTAAACATACCAGAACATCAAACAGCGCATCAACCATTTAAACGTCAGTCAATGCGTGACTGCATATAAACC(C)AACACTTGCGTTGAATACCACCTGCTCTAGAAATATGAAGAAA >allele_02_JEL275 TTTGAAGACAACTGATGGCAATCGGAATGAGTTTTGGATTTTTAGTATCGCACGACATGATGAATGGCTTGACTGTATCATCAGTGTTTGCTAGATCTAGACAGTTTAAACATACCAGAACATCAAACAGCGCATCAACCATTTAAACGTCAGTCAATGCGTGACTGCATATAAACC(T)AACACTTGCGTTGAATACCACCTGCTCTAGAAATATGAAGAAA BdSC6.6.2 >allele_01_UM142 TCCTACCTGCTGTTAATGTATCCGGAGCACCTGGAGGTAAAGCTGCCTGTCGATCTTTGAGCGAACGAAGAAGATACAACAACCTCTCTGCAGCCTAAAACGAGTAGCAATGCATGAATTGACAATAACCATATCAGCCTTATCTCGTTTTAAATACGTCTGATAGTCATGTTAGACAACATGGTAATGCATTGGTCGCATCATACCTCTTTGATTTCTGGATTCTTTCGCTTGGCCTCGTTGGAAAGAGCAACCAGGTCATTCTGCAGTGTTGCTACCAACCCACTCATGAATGCTTTCTAGTATGGAAATGCTTGCTATCCAGTTTTTGACAAGTTGTTAAGCCAGGGGAAAAAGGCTT(G)TAAAGAATAACTTGATGGT(C)TGTTAAAATGGTATCAACTATAACAAGACTATCAAATCTGGGT >allele_02_JEL213 TCCTACCTGCTGTTAATGTATCCGGAGCACCTGGAGGTAAAGCTGCCTGTCGATCTTTGAGCGAACGAAGAAGATACAACAACCTCTCTGCAGCCTAAAACGAGTAGCAATGCATGAATTGACAATAACCATATCAGCCTTATCTCGTTTTAAATACGTCTGATAGTCATGTTAGACAACATGGTAATGCATTGGTCGCATCATACCTCTTTGATTTCTGGATTCTTTCGCTTGGCCTCGTTGGAAAGAGCAACCAGGTCATTCTGCAGTGTTGCTACCAACCCACTCATGAATGCTTTCTAGTATGGAAATGCTTGCTATCCAGTTTTTGACAAGTTGTTAAGCCAGGGGAAAAAGGCTT(T)TAAAGAATAACTTGATGGT(T)TGTTAAAATGGTATCAACTATAACAAGACTATCAAATCTGGGT BdSC6.15 >allele_01_JEL197 CTCGCATTGATACAAAACCATATACCAAGACCGAATTATGGTTAGTATATATTATTCGCTGCATTGAGTTTTTAGTTGGCTTGTA(C)CAATCTAACAA(T)GCTGTGTATGAAGCTATCATTCTGAAAATCGGAAATTTGATTCAATCAAGGCTCACGTTGGTTTGCAAATTGACGAAATTCAACTCAGG(A)TTATGCTAAATGATAGCGAGGTTAGTATTGTT(A)TGTTGTTGCATTTACAATGTTTGTTATACACTAATGTCTTG(A)ATATTATG(T)ATATCAGGTTATTGGTGTCAAGGATAGCAGTAAATGGAATTGGGATATTATTGAAGAAATAGTATCTGGTCCACTTTTGAATTCAAAACG >allele_02_JEL275 CTCGCATTGATACAAAACCATATACCAAGACCGAATTATGGTTAGTATATATTATTCGCTGCATTGAGTTTTTAGTTGGCTTGTA(C)CAATCTAACAA(T)GCTGTGTATGAAGCTATCATTCTGAAAATCGGAAATTTGATTCAATCAAGGCTCACGTTGGTTTGCAAATTGACGAAATTCAACTCAGG(G)TTATGCTAAATGATAGCGAGGTTAGTATTGTT(A)TGTTGTTGCATTTACAATGTTTGTTATACACTAATGTCTTG(A)ATATTATG(T)ATATCAGGTTATTGGTGTCAAGGATAGCAGTAAATGGAATTGGGATATTATTGAAGAAATAGTATCTGGTCCACTTTTGAATTCAAAACG >allele_03_UM142 CTCGCATTGATACAAAACCATATACCAAGACCGAATTATGGTTAGTATATATTATTCGCTGCATTGAGTTTTTAGTTGGCTTGTA(T)CAATCTAACAA(T)GCTGTGTATGAAGCTATCATTCTGAAAATCGGAAATTTGATTCAATCAAGGCTCACGTTGGTTTGCAAATTGACGAAATTCAACTCAGG(G)TTATGCTAAATGATAGCGAGGTTAGTATTGTT(A)TGTTGTTGCATTTACAATGTTTGTTATACACTAATGTCTTG(G)ATATTATG(C)ATATCAGGTTATTGGTGTCAAGGATAGCAGTAAATGGAATTGGGATATTATTGAAGAAATAGTATCTGGTCCACTTTTGAATTCAAAACG >allele_04_JEL649 CTCGCATTGATACAAAACCATATACCAAGACCGAATTATGGTTAGTATATATTATTCGCTGCATTGAGTTTTTAGTTGGCTTGTA(C)CAATCTAACAA(G)GCTGTGTATGAAGCTATCATTCTGAAAATCGGAAATTTGATTCAATCAAGGCTCACGTTGGTTTGCAAATTGACGAAATTCAACTCAGG(G)TTATGCTAAATGATAGCGAGGTTAGTATTGTT(G)TGTTGTTGCATTTACAATGTTTGTTATACACTAATGTCTTG(G)ATATTATG(C)ATATCAGGTTATTGGTGTCAAGGATAGCAGTAAATGGAATTGGGATATTATTGAAGAAATAGTATCTGGTCCACTTTTGAATTCAAAACG BdSC7.6 >allele_01_JEL197 TTGAATTCCAAAGTAGCCAC(G)CCAGCATGCACCATCACTGGAACCTTGTGCGTACTATAGGGTGACGAAACTGAAAATAC(C)ACTGCAGTTCGAATCTCGTGCGAAGGCGTGTAAGTGATTGCAACAAAACTTTCACTAAATGGATCAATCACCAAAGAAGATGGATAAAATTCTAAATCAGGAAACTCTTTTTCAAGCTGAAACTTGACCGGATAGTTGACATCACCAATGTTTTTGAGACCAAGTTTTTGCTCGTACGAGTTGCCTATTAAACATTCAGAAAACTCGAGTGCAATTTTTGAAACAATTAAAACGGCTTCACGACCGAGACCTATGAGCTCTATTTCGTAGGTTTCCATGCTTGTACCAATAATAAGGCGGCCTGGCGATGG(G)TTTTCCTCGTGGGGATTGAA >allele_02_JEL648 TTGAATTCCAAAGTAGCCAC(A)CCAGCATGCACCATCACTGGAACCTTGTGCGTACTATAGGGTGACGAAACTGAAAATAC(A)ACTGCAGTTCGAATCTCGTGCGAAGGCGTGTAAGTGATTGCAACAAAACTTTCACTAAATGGATCAATCACCAAAGAAGATGGATAAAATTCTAAATCAGGAAACTCTTTTTCAAGCTGAAACTTGACCGGATAGTTGACATCACCAATGTTTTTGAGACCAAGTTTTTGCTCGTACGAGTTGCCTATTAAACATTCAGAAAACTCGAGTGCAATTTTTGAAACAATTAAAACGGCTTCACGACCGAGACCTATGAGCTCTATTTCGTAGGTTTCCATGCTTGTACCAATAATAAGGCGGCCTGGCGATGG(A)TTTTCCTCGTGGGGATTGAA BdSC8.10 >allele_01_CW34 CATTCACTACTCATTTCAAGCCACCTGTG(C)TGGGTTTATTTGCACGAGTAATGGGTATTCGTAAAGCCAGTGGACGGTCTCCGTCAACCGCTTTGACCCAGGATATTTCTCCGGGTAATTGTTGGGCCATGTCAGGTAAAATTAAATTCAAGTGGTGAAAATGTGTTGATGTTTGGATAAACAATGTTTGATAATTTGTTCTACCCGTGACATGATGATTAGACTCGAGCGGCACGTTGGCGATATCCCTTGCCGAGCC(C)ATCATACCAACTGATATGACCATTGAGCATTCTCATATCCAAACGTCCATT(A)GTGACCGACACACATCAGCTCCACGCCAAATCGAACTTTGGGCAGTCTTTGATGCTGTAGAATTTGCTAAACTTGATCTAAACAACAATCAGGTCAGACTAC >allele_02_JEL197 CATTCACTACTCATTTCAAGCCACCTGTG(C)TGGGTTTATTTGCACGAGTAATGGGTATTCGTAAAGCCAGTGGACGGTCTCCGTCAACCGCTTTGACCCAGGATATTTCTCCGGGTAATTGTTGGGCCATGTCAGGTAAAATTAAATTCAAGTGGTGAAAATGTGTTGATGTTTGGATAAACAATGTTTGATAATTTGTTCTACCCGTGACATGATGATTAGACTCGAGCGGCACGTTGGCGATATCCCTTGCCGAGCC(T)ATCATACCAACTGATATGACCATTGAGCATTCTCATATCCAAACGTCCATT(A)GTGACCGACACACATCAGCTCCACGCCAAATCGAACTTTGGGCAGTCTTTGATGCTGTAGAATTTGCTAAACTTGATCTAAACAACAATCAGGTCAGACTAC >allele_03_UM142 CATTCACTACTCATTTCAAGCCACCTGTG(T)TGGGTTTATTTGCACGAGTAATGGGTATTCGTAAAGCCAGTGGACGGTCTCCGTCAACCGCTTTGACCCAGGATATTTCTCCGGGTAATTGTTGGGCCATGTCAGGTAAAATTAAATTCAAGTGGTGAAAATGTGTTGATGTTTGGATAAACAATGTTTGATAATTTGTTCTACCCGTGACATGATGATTAGACTCGAGCGGCACGTTGGCGATATCCCTTGCCGAGCC(C)ATCATACCAACTGATATGACCATTGAGCATTCTCATATCCAAACGTCCATT(G)GTGACCGACACACATCAGCTCCACGCCAAATCGAACTTTGGGCAGTCTTTGATGCTGTAGAATTTGCTAAACTTGATCTAAACAACAATCAGGTCAGACTAC BdSC9.7 >allele_01_JEL423 TGTTTTGTTGTAGACTTTTGGTAATGGGGAAAATAGACGATGCCAAAATAGCACTGTCTACATTTTTGAAAATATTTGTAGAGGATCATCCAAATGCGATTGTATCAACACAGCGACTGTCTGGACGAGATTTACCAGTATTCACATCTGCATATCTGAATTTTGCACAACTGACTATTGAATGCATCGATCGCCAAGCAGGCGATCTATATATGAATTTAGTGCACTTTTATACAACTGTTCTTGGTGAAGATGGATACATGCTTACGGTATGAGTTTAAATCCTTTGCCATGAGT(T)GTATGT(TTGATGT)CTGCATATCTTGTATAGTTTTTGACTGTTGCGATTTAGATTGCAGAGACTATTGCAGCAGCATACTTTGA(T)CAAGGACCACGCAAGAAGCAGGACAATCCATTGATGAATATGATG >allele_02_JEL270 TGTTTTGTTGTAGACTTTTGGTAATGGGGAAAATAGACGATGCCAAAATAGCACTGTCTACATTTTTGAAAATATTTGTAGAGGATCATCCAAATGCGATTGTATCAACACAGCGACTGTCTGGACGAGATTTACCAGTATTCACATCTGCATATCTGAATTTTGCACAACTGACTATTGAATGCATCGATCGCCAAGCAGGCGATCTATATATGAATTTAGTGCACTTTTATACAACTGTTCTTGGTGAAGATGGATACATGCTTACGGTATGAGTTTAAATCCTTTGCCATGAGT(T)GTATGT(-------)CTGCATATCTTGTATAGTTTTTGACTGTTGCGATTTAGATTGCAGAGACTATTGCAGCAGCATACTTTGA(T)CAAGGACCACGCAAGAAGCAGGACAATCCATTGATGAATATGATG >allele_03_UM142 TGTTTTGTTGTAGACTTTTGGTAATGGGGAAAATAGACGATGCCAAAATAGCACTGTCTACATTTTTGAAAATATTTGTAGAGGATCATCCAAATGCGATTGTATCAACACAGCGACTGTCTGGACGAGATTTACCAGTATTCACATCTGCATATCTGAATTTTGCACAACTGACTATTGAATGCATCGATCGCCAAGCAGGCGATCTATATATGAATTTAGTGCACTTTTATACAACTGTTCTTGGTGAAGATGGATACATGCTTACGGTATGAGTTTAAATCCTTTGCCATGAGT(C)GTATGT(TTGATGT)CTGCATATCTTGTATAGTTTTTGACTGTTGCGATTTAGATTGCAGAGACTATTGCAGCAGCATACTTTGA(C)CAAGGACCACGCAAGAAGCAGGACAATCCATTGATGAATATGATG BdSC12.4 >allele_01_JEL289 GAAACTCACAATAAAAGTACAAGTGCACTTCATGCAGTTTGGGCACAATAAATGCCCAATATTTACGTGGCAATCCTCCAGAAGAA(C)TATACTGCACATCAAGCAGATAGTAACTCTCGCCAATTTGATGCAAATCCATTTGGGAACAATTGAAAAGTGTGATATTTGACCGGAAAAGCCCTAAACAAACACCTGGATCTACAAAAGCAACATTGATTCTCAAGTGAACCGAATCTGCCTCCAGTATAGTTTCAATATTGGCTGAAGAACGAGAAAGTTCCGTTCCACTGCCATTATGCCTTGTACGAATAAGACTTGCTGCAGAATACAGTGTTGATGAGCTTGGATGTGATCCATCATGAATTAGCATACTACGAAGAATACGTTCTCTGGTCAAATTCTCAATATCATTGCGAAGTGAAATGACAGAGTTGCGCATA >allele_02_JEL270 GAAACTCACAATAAAAGTACAAGTGCACTTCATGCAGTTTGGGCACAATAAATGCCCAATATTTACGTGGCAATCCTCCAGAAGAA(T)TATACTGCACATCAAGCAGATAGTAACTCTCGCCAATTTGATGCAAATCCATTTGGGAACAATTGAAAAGTGTGATATTTGACCGGAAAAGCCCTAAACAAACACCTGGATCTACAAAAGCAACATTGATTCTCAAGTGAACCGAATCTGCCTCCAGTATAGTTTCAATATTGGCTGAAGAACGAGAAAGTTCCGTTCCACTGCCATTATGCCTTGTACGAATAAGACTTGCTGCAGAATACAGTGTTGATGAGCTTGGATGTGATCCATCATGAATTAGCATACTACGAAGAATACGTTCTCTGGTCAAATTCTCAATATCATTGCGAAGTGAAATGACAGAGTTGCGCATA APRT13 >allele_01_JEL197 CACCTCGTCCAAACCAACAAGCCCGTGCACTACCCATCCTTCCCGAACTCCGCTCAAGTGGAGTGCTTCAGCCATAATCCGGCCGATATCTTTTGAAAA(T)ACTCCAACCACCATTTTGGAAGGGCGAGCGGGATTAGTGAGCGGCCCAAGCCTGTAGATAAAGTTTGGTTAATCAGCGCGCATCAATAAGCTTATTATGCATCGCAT(G)AGTATAGTAAACTATTCCAAAAAACACTTGCATGTTAAATATTGTACGAACACCAAGCTCTTT(T)CGAGAGGCTGCCACATGTCTCATGGCTGGATGGAAACTCTGAGCAAATAAGAAGCAAAAATTACTCGAGTCGAGGATTGAGCCTACCGCTGTTGGAGAAACAGACTCCAAGTGGCAACCTAGTGCTTCAAGAACATCTGCAGATCCTGATGTTGATGAGGAAGCTCTGCTGCCGTGCTATTAAATATATTTGATGTGTAGATGTTTTAAAATGATATGAATTAGCACATGCCTCAAGCTAGATGCACACTATAACAATCAGCTTATTAAAAAGGTAAAACAAAGACACATGTTGAATGTAGGAAAGTCTAGATCGATATAGTATCGAATGCAGTACCTTGGCAACTTTTACTCCAGCTCCAGCAACAATGATGGATGCAGCGGTAGATACATTAAATGTATTTTGGCCATCACCTCCAGTGCCAACAATATCA(G)CTACATCAAATGGCAGCTCAACTGGGAGTGCCTTACTCTGCATGGCTTTG >allele_02_CW36 CACCTCGTCCAAACCAACAAGCCCGTGCACTACCCATCCTTCCCGAACTCCGCTCAAGTGGAGTGCTTCAGCCATAATCCGGCCGATATCTTTTGAAAA(C)ACTCCAACCACCATTTTGGAAGGGCGAGCGGGATTAGTGAGCGGCCCAAGCCTGTAGATAAAGTTTGGTTAATCAGCGCGCATCAATAAGCTTATTATGCATCGCAT(G)AGTATAGTAAACTATTCCAAAAAACACTTGCATGTTAAATATTGTACGAACACCAAGCTCTTT(T)CGAGAGGCTGCCACATGTCTCATGGCTGGATGGAAACTCTGAGCAAATAAGAAGCAAAAATTACTCGAGTCGAGGATTGAGCCTACCGCTGTTGGAGAAACAGACTCCAAGTGGCAACCTAGTGCTTCAAGAACATCTGCAGATCCTGATGTTGATGAGGAAGCTCTGCTGCCGTGCTATTAAATATATTTGATGTGTAGATGTTTTAAAATGATATGAATTAGCACATGCCTCAAGCTAGATGCACACTATAACAATCAGCTTATTAAAAAGGTAAAACAAAGACACATGTTGAATGTAGGAAAGTCTAGATCGATATAGTATCGAATGCAGTACCTTGGCAACTTTTACTCCAGCTCCAGCAACAATGATGGATGCAGCGGTAGATACATTAAATGTATTTTGGCCATCACCTCCAGTGCCAACAATATCA(G)CTACATCAAATGGCAGCTCAACTGGGAGTGCCTTACTCTGCATGGCTTTG >allele_03_JEL648 CACCTCGTCCAAACCAACAAGCCCGTGCACTACCCATCCTTCCCGAACTCCGCTCAAGTGGAGTGCTTCAGCCATAATCCGGCCGATATCTTTTGAAAA(C)ACTCCAACCACCATTTTGGAAGGGCGAGCGGGATTAGTGAGCGGCCCAAGCCTGTAGATAAAGTTTGGTTAATCAGCGCGCATCAATAAGCTTATTATGCATCGCAT(G)AGTATAGTAAACTATTCCAAAAAACACTTGCATGTTAAATATTGTACGAACACCAAGCTCTTT(G)CGAGAGGCTGCCACATGTCTCATGGCTGGATGGAAACTCTGAGCAAATAAGAAGCAAAAATTACTCGAGTCGAGGATTGAGCCTACCGCTGTTGGAGAAACAGACTCCAAGTGGCAACCTAGTGCTTCAAGAACATCTGCAGATCCTGATGTTGATGAGGAAGCTCTGCTGCCGTGCTATTAAATATATTTGATGTGTAGATGTTTTAAAATGATATGAATTAGCACATGCCTCAAGCTAGATGCACACTATAACAATCAGCTTATTAAAAAGGTAAAACAAAGACACATGTTGAATGTAGGAAAGTCTAGATCGATATAGTATCGAATGCAGTACCTTGGCAACTTTTACTCCAGCTCCAGCAACAATGATGGATGCAGCGGTAGATACATTAAATGTATTTTGGCCATCACCTCCAGTGCCAACAATATCA(A)CTACATCAAATGGCAGCTCAACTGGGAGTGCCTTACTCTGCATGGCTTTG >allele_04_JEL649 CACCTCGTCCAAACCAACAAGCCCGTGCACTACCCATCCTTCCCGAACTCCGCTCAAGTGGAGTGCTTCAGCCATAATCCGGCCGATATCTTTTGAAAA(C)ACTCCAACCACCATTTTGGAAGGGCGAGCGGGATTAGTGAGCGGCCCAAGCCTGTAGATAAAGTTTGGTTAATCAGCGCGCATCAATAAGCTTATTATGCATCGCAT(A)AGTATAGTAAACTATTCCAAAAAACACTTGCATGTTAAATATTGTACGAACACCAAGCTCTTT(T)CGAGAGGCTGCCACATGTCTCATGGCTGGATGGAAACTCTGAGCAAATAAGAAGCAAAAATTACTCGAGTCGAGGATTGAGCCTACCGCTGTTGGAGAAACAGACTCCAAGTGGCAACCTAGTGCTTCAAGAACATCTGCAGATCCTGATGTTGATGAGGAAGCTCTGCTGCCGTGCTATTAAATATATTTGATGTGTAGATGTTTTAAAATGATATGAATTAGCACATGCCTCAAGCTAGATGCACACTATAACAATCAGCTTATTAAAAAGGTAAAACAAAGACACATGTTGAATGTAGGAAAGTCTAGATCGATATAGTATCGAATGCAGTACCTTGGCAACTTTTACTCCAGCTCCAGCAACAATGATGGATGCAGCGGTAGATACATTAAATGTATTTTGGCCATCACCTCCAGTGCCAACAATATCA(A)CTACATCAAATGGCAGCTCAACTGGGAGTGCCTTACTCTGCATGGCTTTG R6046 >allele_01_CW26 GGTCGGCGGTCGTACTGGCAACCTCACCGATGCCATTACCATCACCCGCAAGGATGCTATTTTTACCGTCGAGATTGCTCCCAATGTTCGATTTGCCAAGCGTTACTTGAAGTACCTCACCAAGAAGTTCCTCAAGAAGTACATGCTTCGCGATTGGCTCCGTGTTATTTCTACTGACAAGACTTCCTACGTTGTCAAGTACTTCAACATTGCCAATAACGAGGCTGATGAAGAGTAATGGCTTGTTCTATTTCAAATATATAGTTCAGTCTCCTGTTAATTATTGTATAGATTTGTGTATTTCAGAATGGTTTAGAGTGTGGAATACAATCTGATTGTGCAGAGTATTTTTTCCAAAAAATTCCGCAAAAAACAATTCCGATTTTGACATAAATATCAACTCCAATTCTACTTTGCCAGTACAA(--)GTCTTATCTATAGGATGCGCACTCTAC >allele_02_JEL231 GGTCGGCGGTCGTACTGGCAACCTCACCGATGCCATTACCATCACCCGCAAGGATGCTATTTTTACCGTCGAGATTGCTCCCAATGTTCGATTTGCCAAGCGTTACTTGAAGTACCTCACCAAGAAGTTCCTCAAGAAGTACATGCTTCGCGATTGGCTCCGTGTTATTTCTACTGACAAGACTTCCTACGTTGTCAAGTACTTCAACATTGCCAATAACGAGGCTGATGAAGAGTAATGGCTTGTTCTATTTCAAATATATAGTTCAGTCTCCTGTTAATTATTGTATAGATTTGTGTATTTCAGAATGGTTTAGAGTGTGGAATACAATCTGATTGTGCAGAGTATTTTTTCCAAAAAATTCCGCAAAAAACAATTCCGATTTTGACATAAATATCAACTCCAATTCTACTTTGCCAGTACAA(CA)GTCTTATCTATAGGATGCGCACTCTAC 8702x2 >allele_01_JEL197 GTACTGGATTTCCCTCAACCAATCAAAAACCTGCT(T)CGACTACGAGCTCTTCGTCAGCATCCCAGCAATTATTTGATGCGTTTCAATCTGCTCCTACTTCATCGAGTCAACAGCAGCAGCAGCAGGCTCAAACCTCGATGAAAAGCTCGATCCTGTCACTTTATGGAGCACCATCCCCTGTTCGAGCTGCTAATAT >allele_02_CW34 GTACTGGATTTCCCTCAACCAATCAAAAACCTGCT(C)CGACTACGAGCTCTTCGTCAGCATCCCAGCAATTATTTGATGCGTTTCAATCTGCTCCTACTTCATCGAGTCAACAGCAGCAGCAGCAGGCTCAAACCTCGATGAAAAGCTCGATCCTGTCACTTTATGGAGCACCATCCCCTGTTCGAGCTGCTAATAT 6164Y2 >allele_01_JEL275 CCACACATGGTAATTATATATATATTTGACTGTTTGAATGCAGCTCTTACTGACATTTT(-)GATTATTATTATAGTTTCAATCAAA >allele_02_JEL289 CCACACATGGTAATTATATATATATTTGACTGTTTGAATGCAGCTCTTACTGACATTTT(T)GATTATTATTATAGTTTCAATCAAA mb-b13 >allele_01_JEL275 TCATCATAATGCTGAGTTGAGGATCAATCGGTATGCGTCCTAGATTCAATGCATATGGCATGTATTGATTTTAAAATGAGTAAATATATATATA(--)AATGACAACCAACAAGCTACACAGTACCTAGA >allele_02_JEL428 TCATCATAATGCTGAGTTGAGGATCAATCGGTATGCGTCCTAGATTCAATGCATATGGCATGTATTGATTTTAAAATGAGTAAATATATATATA(TA)AATGACAACCAACAAGCTACACAGTACCTAGA [Due to incomplete disequilibrium and the inability to infer phase BdC18 is divided into two loci BdC18.1 and BdC18.2] BdC18.1 >allele_01_JEL275 AAAATACTGCACAATGGTTTCAACTTATGATTT(C)CAACCTTTTGAATTTACATTTAGAGTACGATCGAGTTTCCAACACAATCTAT(C)CAGATTTCCAGAATATCAGAAAGTGCAGTTTAAAACACGTGACCCATACAACTTGGTTTTACA(G)CAAAGTGTGTTTTCGCCTGTTTTCCCCACGACAAACAATTTAACGAGACATCAATGGTAAATGCCACTATGACCCCTGACCGGCGAGTCGGCCTGCCATTGAATCCGACATCCTCTCTCATCCATCCATCCGTTATATTTACCAACAAGCTCATGCATGCATTTAACCTGGATTGGTT(C)TCAAGCCAAGGTTTAAAGTCAGATTGAGTGTATTGGAAACTCGCCAATGTGCACAACCCTTTCGAGT >allele_02_JEL270 AAAATACTGCACAATGGTTTCAACTTATGATTT(C)CAACCTTTTGAATTTACATTTAGAGTACGATCGAGTTTCCAACACAATCTAT(T)CAGATTTCCAGAATATCAGAAAGTGCAGTTTAAAACACGTGACCCATACAACTTGGTTTTACA(G)CAAAGTGTGTTTTCGCCTGTTTTCCCCACGACAAACAATTTAACGAGACATCAATGGTAAATGCCACTATGACCCCTGACCGGCGAGTCGGCCTGCCATTGAATCCGACATCCTCTCTCATCCATCCATCCGTTATATTTACCAACAAGCTCATGCATGCATTTAACCTGGATTGGTT(C)TCAAGCCAAGGTTTAAAGTCAGATTGAGTGTATTGGAAACTCGCCAATGTGCACAACCCTTTCGAGT >allele_03_UM142 AAAATACTGCACAATGGTTTCAACTTATGATTT(T)CAACCTTTTGAATTTACATTTAGAGTACGATCGAGTTTCCAACACAATCTAT(T)CAGATTTCCAGAATATCAGAAAGTGCAGTTTAAAACACGTGACCCATACAACTTGGTTTTACA(C)CAAAGTGTGTTTTCGCCTGTTTTCCCCACGACAAACAATTTAACGAGACATCAATGGTAAATGCCACTATGACCCCTGACCGGCGAGTCGGCCTGCCATTGAATCCGACATCCTCTCTCATCCATCCATCCGTTATATTTACCAACAAGCTCATGCATGCATTTAACCTGGATTGGTT(C)TCAAGCCAAGGTTTAAAGTCAGATTGAGTGTATTGGAAACTCGCCAATGTGCACAACCCTTTCGAGT >allele_04_UM142 AAAATACTGCACAATGGTTTCAACTTATGATTT(C)CAACCTTTTGAATTTACATTTAGAGTACGATCGAGTTTCCAACACAATCTAT(C)CAGATTTCCAGAATATCAGAAAGTGCAGTTTAAAACACGTGACCCATACAACTTGGTTTTACA(G)CAAAGTGTGTTTTCGCCTGTTTTCCCCACGACAAACAATTTAACGAGACATCAATGGTAAATGCCACTATGACCCCTGACCGGCGAGTCGGCCTGCCATTGAATCCGACATCCTCTCTCATCCATCCATCCGTTATATTTACCAACAAGCTCATGCATGCATTTAACCTGGATTGGTT(T)TCAAGCCAAGGTTTAAAGTCAGATTGAGTGTATTGGAAACTCGCCAATGTGCACAACCCTTTCGAGT BdC18.2 >allele_01_JEL277 AACTTTCACTGGACAATAGTGTACAGTACAAGGGATTAGTATGGATTGGATATAGACAGAGAGAG(AG)AAGTCAGAGTTTTATGACTCGAT >allele_01_JEL275 AACTTTCACTGGACAATAGTGTACAGTACAAGGGATTAGTATGGATTGGATATAGACAGAGAGAG(--)AAGTCAGAGTTTTATGACTCGAT CTSYN1 >allele_01_JEL225 ATTCATCGGATAGT(G)CTGCCTTGGGTCTACCACAAACCATTCAGTCTTGATCTTTTTTGTACAAGATTACTGACTGCATCCACTCTTCGCTTTTACTGCTCCGTAAATTCCCAGTCAAAACCTACTGCACTCACCATGACATCCTCAGCAGCTCCTATTCGCCAGCCTGACTGGCATATTCCTGCTGGAACTACTGTTCCTCGGCTATACATCAACAACTCTTTGACTCGCAAAAAGGTACGGAATTCTACATTTATATTCAGCTGCCGTCGTTTGTGAATTGGAATTGACGATGATTCAGCAGCAGTTGAATGGTTTCGGAAATTCAGTTACTGATATGGTTGGGCGTAACATGGATCTATACTTGTATAGGAGTT(G)TTTGTTCCTGAAAAAGGACGTCGAGTCACTTGGTATTCTTGCGGGCCAACCGTTTATGACAAATCCCATGTTGGTCATGCCAGGTGAGCTGGTTTGATGCTGGCAAACTGCTCTGGATTTCAACCACTCAT >allele_02_CW34 ATTCATCGGATAGT(A)CTGCCTTGGGTCTACCACAAACCATTCAGTCTTGATCTTTTTTGTACAAGATTACTGACTGCATCCACTCTTCGCTTTTACTGCTCCGTAAATTCCCAGTCAAAACCTACTGCACTCACCATGACATCCTCAGCAGCTCCTATTCGCCAGCCTGACTGGCATATTCCTGCTGGAACTACTGTTCCTCGGCTATACATCAACAACTCTTTGACTCGCAAAAAGGTACGGAATTCTACATTTATATTCAGCTGCCGTCGTTTGTGAATTGGAATTGACGATGATTCAGCAGCAGTTGAATGGTTTCGGAAATTCAGTTACTGATATGGTTGGGCGTAACATGGATCTATACTTGTATAGGAGTT(A)TTTGTTCCTGAAAAAGGACGTCGAGTCACTTGGTATTCTTGCGGGCCAACCGTTTATGACAAATCCCATGTTGGTCATGCCAGGTGAGCTGGTTTGATGCTGGCAAACTGCTCTGGATTTCAACCACTCAT HMG17 >allele_01_PM5 GTGCAC(T)GATTTCTTTGTGATGATCACGTCGGAATAAAAGAAATGCATTGAGTGGTCGAGCAATACATCCATCATCATAAACTGACCGAGGTTTACGACTTTTTAAACTCGGAGTGTTCAATGGAGT(G)TGAAGC(A)AACAATTGGGTAC(T)CC(A)TCAAGTGAATCGTACTTTAAACGTTTAGGTTGAGATACATCATCGATAGTAGGCTGTTCAATTCGAGGTTGATCATACCCT(A)TCAAACTAGAATCAAGATTC(A)TAGTAGATTGTGGTGTGGGTGTTGA(T)GGAATATGCAAATCATATTCTGATCCGG(C)TGAATGAGTTAAACCACAAGTCGCATTAGAAAGACTAAATAAAGTGGATGGATTCACAGTTGGAAACTCGA(T)ATCATTCAACTGCTTAAATGTAGAATCGTTTAATTGTGGGAGCGAAGCCA(A)CCCATCAAACAATTCCATCAAGGACGAATCAAACAGTT(T)GTTGGTTGAGTTGGTTGATGTATTCAACTGTTGTATTCCCCAGTC(T)GGGAGTGGAAGCGCAGAAACAATTGACG(CC)GATGCAGTACTTGTTGAAGTACTTGTTGAACCTGCACGTGTAGTATGAGCTGTGTT(T)GTACTACTGATTGCAGAAATAAAACCTTTTTGT(T)GTAGTGCAGCAGATTGTAC(A)ACAGGAGCAAACAACTCAAGTCTTGCTTTCTCAATCGTATTGCAAAAAGCT(A)T >allele_02_JEL428 GTGCAC(T)GATTTCTTTGTGATGATCACGTCGGAATAAAAGAAATGCATTGAGTGGTCGAGCAATACATCCATCATCATAAACTGACCGAGGTTTACGACTTTTTAAACTCGGAGTGTTCAATGGAGT(A)TGAAGC(A)AACAATTGGGTAC(T)CC(A)TCAAGTGAATCGTACTTTAAACGTTTAGGTTGAGATACATCATCGATAGTAGGCTGTTCAATTCGAGGTTGATCATACCCT(G)TCAAACTAGAATCAAGATTC(G)TAGTAGATTGTGGTGTGGGTGTTGA(C)GGAATATGCAAATCATATTCTGATCCGG(T)TGAATGAGTTAAACCACAAGTCGCATTAGAAAGACTAAATAAAGTGGATGGATTCACAGTTGGAAACTCGA(T)ATCATTCAACTGCTTAAATGTAGAATCGTTTAATTGTGGGAGCGAAGCCA(A)CCCATCAAACAATTCCATCAAGGACGAATCAAACAGTT(G)GTTGGTTGAGTTGGTTGATGTATTCAACTGTTGTATTCCCCAGTC(C)GGGAGTGGAAGCGCAGAAACAATTGACG(TC)GATGCAGTACTTGTTGAAGTACTTGTTGAACCTGCACGTGTAGTATGAGCTGTGTT(T)GTACTACTGATTGCAGAAATAAAACCTTTTTGT(C)GTAGTGCAGCAGATTGTAC(G)ACAGGAGCAAACAACTCAAGTCTTGCTTTCTCAATCGTATTGCAAAAAGCT(G)T >allele_03_UM142 GTGCAC(G)GATTTCTTTGTGATGATCACGTCGGAATAAAAGAAATGCATTGAGTGGTCGAGCAATACATCCATCATCATAAACTGACCGAGGTTTACGACTTTTTAAACTCGGAGTGTTCAATGGAGT(G)TGAAGC(G)AACAATTGGGTAC(T)CC(A)TCAAGTGAATCGTACTTTAAACGTTTAGGTTGAGATACATCATCGATAGTAGGCTGTTCAATTCGAGGTTGATCATACCCT(A)TCAAACTAGAATCAAGATTC(A)TAGTAGATTGTGGTGTGGGTGTTGA(C)GGAATATGCAAATCATATTCTGATCCGG(T)TGAATGAGTTAAACCACAAGTCGCATTAGAAAGACTAAATAAAGTGGATGGATTCACAGTTGGAAACTCGA(C)ATCATTCAACTGCTTAAATGTAGAATCGTTTAATTGTGGGAGCGAAGCCA(A)CCCATCAAACAATTCCATCAAGGACGAATCAAACAGTT(T)GTTGGTTGAGTTGGTTGATGTATTCAACTGTTGTATTCCCCAGTC(T)GGGAGTGGAAGCGCAGAAACAATTGACG(CT)GATGCAGTACTTGTTGAAGTACTTGTTGAACCTGCACGTGTAGTATGAGCTGTGTT(C)GTACTACTGATTGCAGAAATAAAACCTTTTTGT(C)GTAGTGCAGCAGATTGTAC(G)ACAGGAGCAAACAACTCAAGTCTTGCTTTCTCAATCGTATTGCAAAAAGCT(G)T >allele_04_UM142 GTGCAC(G)GATTTCTTTGTGATGATCACGTCGGAATAAAAGAAATGCATTGAGTGGTCGAGCAATACATCCATCATCATAAACTGACCGAGGTTTACGACTTTTTAAACTCGGAGTGTTCAATGGAGT(G)TGAAGC(A)AACAATTGGGTAC(C)CC(G)TCAAGTGAATCGTACTTTAAACGTTTAGGTTGAGATACATCATCGATAGTAGGCTGTTCAATTCGAGGTTGATCATACCCT(A)TCAAACTAGAATCAAGATTC(A)TAGTAGATTGTGGTGTGGGTGTTGA(T)GGAATATGCAAATCATATTCTGATCCGG(C)TGAATGAGTTAAACCACAAGTCGCATTAGAAAGACTAAATAAAGTGGATGGATTCACAGTTGGAAACTCGA(T)ATCATTCAACTGCTTAAATGTAGAATCGTTTAATTGTGGGAGCGAAGCCA(G)CCCATCAAACAATTCCATCAAGGACGAATCAAACAGTT(T)GTTGGTTGAGTTGGTTGATGTATTCAACTGTTGTATTCCCCAGTC(C)GGGAGTGGAAGCGCAGAAACAATTGACG(TC)GATGCAGTACTTGTTGAAGTACTTGTTGAACCTGCACGTGTAGTATGAGCTGTGTT(T)GTACTACTGATTGCAGAAATAAAACCTTTTTGT(C)GTAGTGCAGCAGATTGTAC(G)ACAGGAGCAAACAACTCAAGTCTTGCTTTCTCAATCGTATTGCAAAAAGCT(A)T